多肽合成儀的問世大大促進了多肽科學的發展。反過來，隨著多肽科學的發展，科學家也對合成儀提出了更高的要求，從而帶動了合成儀的發展。目前多肽合成儀品種繁多，從合成量上分，可分為微克級的，毫克級的，克級的和公斤級的;
 

　　從功能上分，可分為研究型的，小試型的，中試型的，普通生產型的和GMP生產型的;
 

　　從自動化程度上分，可分為全自動的，半自動的和手動的;從通道上分，可分為單通道的和多通道的;
 

　　從技術角度上分，可分為第一代的，第二代的，和第三代的;等等。
 

　　多肽合成儀用于合成各種蛋白質與多肽，進行蛋白質結構、功能以及體外相互作用、免疫學等方面的研究。下面舉例說明多肽合成儀的應用。
 

　　一、合成漢坦病毒核衣殼蛋白抗原多肽片段
 

　　利用多肽合成儀合成漢坦病毒核衣殼蛋白(aal7～66)50個氨基酸殘基的核心序列，以此為抗原，建立了新型的特異性檢測抗漢坦病毒IgG和IgM的酶聯免疫方法。該方法特異性強，靈敏度高，簡便易行，適合基層醫療單位進行診斷。
 

　　二、用于多肽類藥物的研制
 

　　新的活性肽不斷發現對揭開生命奧秘如細胞分化、免疫防御、腫瘤、衰老、生殖、分子進化等以及激素功能有了更深層次的認識。利用多肽合成儀可以快速獲取活性最佳的多肽，加速多肽藥物開發。
 

　　此外，多肽合成儀為組合化學方法的建立奠定了基礎，可用于合成肽組合庫的合成，為組合化學的發展做出了重大貢獻。